Para borrar un archivo o fichero en Python se usa la función remove.

from os import remove
remove('/home/decodigo/Documentos/python/archivos/filename.txt')

Si ejecutas el código, el archivo cuya ruta escribas como argumento desaparece.

Si el archivo no existe se generará un error y quizá debes verificar que existe antes de usar remove, con la función path.exists(«/ruta/filename.txt»).

from os import remove
from os import path
if path.exists("/home/decodigo/Documentos/python/archivos/filename.txt"):
    remove('/home/decodigo/Documentos/python/archivos/filename.txt')

Esperamos que te sirva el ejemplo.